医院目前有沈河、和平、北陵3个院区和4个派驻门诊部。沈河院区主要承载师以上首长救治、学术交流、战救及临床技能培训任务，是全院各院区医疗救治的总依托。和平院区主要承载科研教学、卫勤战备、专科患者救治，是军事医学研发、军地两用人才培训的重要平台。北陵院区主要开设康复医学科，负责伤病员术后康复任务。派驻门诊部主要承担战区机关、各军兵种、省军区等服务保障任务。各点位相对独立，又交叉融合，功能互补，形成了资源整合、功能耦合、发展聚合的部署格局。
患者就医时，须持本人有效身份证件（包括二代居民身份证、户口簿、社会保障卡、护照、军官证等）进行挂号就诊，同时提供本人手机号码等有效联系方式；对未携带有效身份证件的患者，医疗机构须登记其姓名、身份证号、联系方式、家庭住址等信息，首次允许挂普通号进行就诊，并做好宣传工作。再次就诊时则需要提供有效身份证件及联系方式。对急诊和危重患者，医疗机构应先行诊疗救治，待病情稳定后，再核实其身份信息。
导医陪诊：提供专业就诊指导，提前预约专家、预约检查等，医院内全程陪同，并解决异地就医食宿出行问题。 预约挂号：看病就医，预约指定专家号，三甲医院数千专家任您选择。
如遇专家临时因公有事坐诊时间有变更，医院将推荐同等资历可诊治相同疾病的其他医生为您看病服务，也可和医院协调征得医院同意，保留预约号在下次该专家坐诊时再来就诊。
若用户需挂号的医生挂号额已满，系统将推荐可诊治相同疾病的其他医生供用户挂号或挂号预约。